Copa Intertoto 2003
La segona participació del Villarreal a Europa va arribar l’any 2003 amb la disputa de la Copa Intertoto. Els grocs van començar en tercera ronda enfrontant-se al Brescia italià, aconseguint un resultat positiu de 2-0 en el partit d’anada i empatant en el xoc de tornada a un tant en el marcador.
En semifinals el Submarí va jugar amb el Brno de la República Txeca, empatant a un gol en terres txeques i aconseguint una còmoda victòria per 2-0 en El Madrigal. Era tan sol l’avantsala del primer títol europeu del Villarreal.
La gran final del torneig va enfrontar als grocs contra el Heerenveen holandès. L’1-2 collit fora de casa va ser suficient renda com per a aconseguir el primer títol de la història del Villarreal, ja que el partit de tornada va acabar en empat a zero gols. Una nit inoblidable en la qual el Submarí va aconseguir el seu passaport per a jugar en la Copa de la UEFA.
